news 2026/5/1 8:37:07

小分子的语言模型MolT5的使用

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张小明

前端开发工程师

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小分子的语言模型MolT5的使用

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文章目录

  • 前言
  • 零、安装
  • 一、使用步骤
    • 1.引入库
    • 2.获取embedding
  • 总结

前言

这是MolT5的安装和embedding获取(gpu版)。

零、安装

conda activate base conda install-c conda-forge mamba-y conda create-n molt5 python=3.9-y conda activate molt5 mamba install pytorch pytorch-cuda=11.8-c pytorch-c nvidia-y pip install sentencepiece accelerate mamba install-c conda-forge rdkit-y pip install"transformers==4.38.2"# 需要离线的,去下载https://huggingface.co/laituan245/molt5-base,作为./molt5-base

一、使用步骤

1.引入库

import torch from transformers import T5Tokenizer,T5EncoderModel

2.获取embedding

device="cuda"
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