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一、基础信息
多肽名称：丙型肝炎病毒 核心蛋白片段 (59-68)
英文名称：HCV Core Protein (59-68)
三字母序列：Arg-Gly-Arg-Arg-Gln-Pro-Ile-Pro-Lys-Ala
单字母序列：RGRRQPIPKA
氨基酸数量：10 aa
结构特征：线性天然多肽；无 Cys、无二硫键、无 Met、无 Trp/Tyr；无末端乙酰化 / 酰胺化
结构式：
二、理化性质
- 分子式：C50H91N21O12
- 理论分子量：1178.41 Da
- 等电点 pI：强碱性，富含多 Arg、Lys 正电荷残基
- 紫外吸收：无 Trp、Tyr、Phe，280 nm 无紫外吸收，浓度需用 BCA / Bradford 定量
- 溶解性：高密度碱性正电荷 + Gln/Pro 极性骨架，水溶性极好，可直接溶于无菌纯水、pH7.2–7.4 PBS
- 稳定性：无 Cys、Met，无氧化、无分子间聚合，理化性质非常稳定，耐冻融、耐常温短时放置
三、序列分段解析
- N 端碱性核心区 Arg-Gly-Arg-Arg
连续多精氨酸富集强正电荷，是 HCV 核心蛋白核酸结合、蛋白互作、核定位关键基序；
Gly 高柔性，维持肽链灵活构象，不阻碍静电结合。 - 构象调控区 Gln-Pro-Ile-Pro
Gln 极性亲水稳定构象；双 Pro 诱导肽链固定转角，形成 Core 蛋白特有空间结构；
Ile 适度疏水支撑局部骨架，维系蛋白 - 核酸、蛋白 - 蛋白相互作用构型。 - C 端功能收尾区 Lys-Ala
Lys 补充正电荷，强化细胞穿透、核酸结合与免疫原性；
Ala 小侧链封闭末端，无空间位阻，稳定整条片段二级结构。
四、生物功能与作用机理
- 对应HCV Core 核心蛋白 59–68 保守功能域，属于病毒核衣壳蛋白关键区段；
- 强碱性序列介导与病毒基因组 RNA 特异性结合，参与病毒核衣壳组装、包装基因组；
- 具备核定位信号特征，调控 Core 蛋白胞内定位、细胞信号通路、细胞凋亡与脂滴结合；
- 参与 HCV 病毒复制、脂质代谢重塑、宿主细胞周期调控，是抗病毒靶点重要区域。
五、科研应用
- HCV 核心蛋白 RNA 结合机制、核衣壳组装机理研究；
- 病毒核定位信号、细胞胞内转运机制实验工具肽；
- HCV 抗原表位制备、免疫动物多抗 / 单抗制备；
- 抗 HCV 多肽抑制剂、小分子靶向药物筛选模板；
- 碱性多肽与核酸相互作用、蛋白构效关系研究。
六、溶解与储存建议
- 强碱性多肽，直接用无菌超纯水或 PBS 即可快速溶解；
- 无光敏感、无易氧化残基，常规避光密封即可，无需还原剂、无需特殊脱氧环境；
- 冻干粉：-20℃短期保存，长期-80℃密封避光；
- 工作液小体积分装，避免反复冻融，保持结合活性与天然构象。
